After Effects стоит немного в стороне от обычного монтажа: программа не столько склеивает клипы, сколько добавляет к готовому видео то, чего не было в кадре, — анимированную графику, титры, визуальные эффекты. Материалы по программе обычно строятся вокруг ключевых кадров как основного принципа анимации — как задать начальное и конечное состояние объекта, чтобы программа сама просчитала движение между ними.
Отдельная сложная тема — композитинг и работа со слоями эффектов, где несколько элементов совмещаются в один кадр с согласованным светом и перспективой, что роднит After Effects с композитингом в фотографии, но с добавлением времени как ещё одного измерения.